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Le diagnostic direct ne se fait qu’à partir de pièces opératoires voire après ponction du kyste (uniquement par une équipe spécialisée : geste délicat, traitement préalable ….)
Le dépistage doit être réalisé avec au moins 2 techniques différentes :
        Tests de dépistage : IFI,  agglutination, ELISA 
        Tests de  confirmation : immunoélectrophorèse, électrosynérèse, Western blot
        Le Western blot présente  des profils de bandes spécifiques de chaque espèce (E. granulosus et E. multilocularis)
      
Risque de  réaction croisée avec l'échinococcose alvéolaire et la cysticercose
      Négatif possible en cas de kyste calcifié
        Positivité :  80-90% dans les formes hépatiques, 50-70% dans les formes pulmonaires
      
On peut  observer 4-6 semaines après un traitement chirurgical une importante ascension  des titres d’Ac.
        Après  guérison, la négativation des Ac est généralement obtenue après 15-24 mois.
Sensibilité moins bonne chez l’enfant de moins de 15 ans et en cas de localisations pulmonaires, cérébrales, osseuses.
La sérologie doit être réalisée 1, 6, 12 et 24 mois après  l’intervention.
        Pronostic  favorable : 
        - Sérologie négative avant l’opération  et négative 1 an après
        - Taux d’Ac faible avant l’opération  et négatif 1,5 ans après
        - Diminution faible mais continue des taux d’Ac  2 ans après l’opération
        Pronostic  défavorable (réapparition de l’infection) :
- Taux d’Ac qui reste élevé 2 ans après l’opération  ou qui présente de faibles fluctuations sans diminution significative
            - Taux d’Ac qui chute après l’opération  mais qui remonte régulièrement